Julia Gustavsen travaille comme bioinformaticienne chez SOPHiA GENETICS. Elle analyse des données NGS et interagit avec des clients et collègues du monde entier. Ses intérêts professionnels incluent la bioinformatique, la génomique, la métagénomique, l’analyse de gènes spécifiques, les analyses de réseaux, la « data science » et la programmation (R, python).
Julia s’est établie en Suisse en 2016, après l’obtention de son doctorat à l’Université de Colombie-Britannique (UBC). Durant sa thèse, elle a examiné les dynamiques spatiales et temporelles des virus et microbes aquatiques. Julia aime analyser de manière rigoureuse des jeux de données complexes et communiquer les résultats à ses collègues et clients. Elle prête beaucoup d’attention aux nouvelles techniques d’analyse et de visualisation.
Julia est originaire du Nouveau-Brunswick, une petite province bilingue anglais-français sur la côte Est du Canada. Elle aime faire de la marche, du ski, explorer la Suisse, et contribue à des projets « open-source » durant son temps libre.
Téléchargez mon CVDoctorat en océanographie biologique, 2016
Université de la Colombie-Britannique
BSc(Hons) en Biologie, 2005
Université du Nouveau-Brunswick
BA en Anglais, 2005
Université du Nouveau-Brunswick
2018 OpenCon switzerland - Code sharing and review in the open with rOpenSci Bern, Switzerland
2016 International Society for Microbial Ecology: Oral presentation: “Network analysis reveals the strong role of the environment in structuring microbial communities in a estuarine environment “ Poster presentation: Phylogenetic dynamics of marine viruses and their putative hosts” Montreal,PQ, Canada
2016 Viruses of microbes (EMBO Conference) : Poster presentations: “Temporal shifts in the phylogenetic structure of viral and host communities implies their central role as structuring elements in marine planktonic communities.” and “Simple and reproducible visualization of virus-host co-occurrence networks using RCy3 and Cytoscape.” Liverpool, United Kingdom
2014 Viruses of microbes (EMBO Conference): Poster presentation: “Describing the richness of the Picornavirales in coastal waters along a nutrient gradient using high-throughput sequencing.” ETH, Zurich, Switzerland.
2013 Aquatic Virus Workshop 7: Poster presentation: “Distribution and patchiness of Picornavirales in coastal waters.” University of South Florida, Saint Petersburg, Florida, USA.
2013 Center for Microbial Diversity and Evolution/CIFAR Integrated Microbial Diversity: Poster presentation: “The high richness of aquatic RNA viral communities in coastal British Columbia revealed using amplicon deep sequencing.” Whistler, BC.
2012 Canadian Society for Microbiology Conference: Oral Presentation: “The uneven structure of RNA viral communities in coastal B.C. revealed using amplicon deep sequencing.” Vancouver, BC.
2012 Center for Microbial Diversity and Evolution: Poster presentation: “The uneven structure of aquatic RNA viral communities in coastal British Columbia revealed using deep amplicon sequencing.” Harrison Hot Springs, BC.
2012 CIFAR Integrated Microbial Diversity: Poster presentation: “The uneven structure of aquatic RNA viral communities in coastal British Columbia revealed using deep amplicon sequencing.” Quebec City, QC.
2011 UBC/ SFU/ UVic/ VIU Ecology and Evolution Retreat: Poster presentation: “RNA viral richness at Jericho Pier.” Brackendale, BC
2011 Center for Microbial Diversity and Evolution: Poster presentation: “Viral and bacterial abundances at Jericho Pier (Vancouver, BC) show variation over time and correlation with environmental parameters.” Harrison Hot Springs, BC.